2017.3.6にR-3.3.3が公開されました。Linux, (Mac) OS XやWIndowsにはPrecompiled binary distributionがありますが，Raspbian用には公開されていません。
ここでは，R-3.3.3のソースコードをビルドしてインストールする方法について説明します。下記の画面はR-3.3.3をビルドしたRaspbian jessie with PIXELでRStudio Desktopを起動したものです。
以下の手順は[1]を参考にして，足りないパッケージを追加して，libR.soを作成するようにしたものです。RStudio Desktopをインストールした環境で行ったので，環境によって不足するパッケージがあるかもしれません。
sudo apt-get update sudo apt-get upgrade -y sudo apt-get install -y gfortran libreadline6-dev libx11-dev libxt-dev libpng-dev libjpeg-dev libcairo2-dev xvfb libcurl4-openssl-dev texinfo cd /home/pi/ mkdir R_HOME cd R_HOME wget http://cran.rstudio.com/src/base/R-3/R-3.3.3.tar.gz tar zxvf R-3.3.3.tar.gz cd R-3.3.3/ ./configure --with-cairo --with-jpeglib --enable-R-shlib make sudo make install